在完成移交程序后，李四放棄了張三的所有股東權(quán)益。協(xié)議簽署后，張三在工商登記管理部門的股東由李四變更為王五。然而，張三沒有向李四支付股權(quán)款項，李四向法院提起訴訟，要求王五支付40萬元股權(quán)轉(zhuǎn)讓款。王五辯稱，股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議約定的支付主體為張三公司，張三公司申請的銀行貸款目前尚未獲得批準，無法支付股權(quán)轉(zhuǎn)讓款。人民法院不支持王五的辯護，裁定王五向李四支付40萬元股權(quán)轉(zhuǎn)讓費。 在股權(quán)轉(zhuǎn)讓過程中，同意將公司部分財產(chǎn)作為股權(quán)轉(zhuǎn)讓資金的，其行為是處置公司資產(chǎn)，這將導致該部分股權(quán)對應的出資缺陷，類似于撤回出資，股權(quán)轉(zhuǎn)讓時的轉(zhuǎn)讓資金可能遠遠大于原注冊資本。本協(xié)議違反《公司法》強制性規(guī)定，侵犯公司財產(chǎn)，損害第三方利益。因此，如果《股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議》規(guī)定以公司財產(chǎn)作為股權(quán)轉(zhuǎn)讓價款，則本協(xié)議中關(guān)于該部分的協(xié)議因損害第三方利益而無效。

但在《股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議》中，以公司部分財產(chǎn)作為股權(quán)轉(zhuǎn)讓價款的協(xié)議無效，不影響本協(xié)議其他協(xié)議的效力。其他約定的部分仍然有效。因此，股權(quán)受讓人仍需根據(jù)股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議支付相應的股權(quán)轉(zhuǎn)讓價款。