企業(yè)治理水平落后、經(jīng)營方式陳舊。中國的企業(yè)正在改制中，現(xiàn)代企業(yè)制度尚未普遍建立，企業(yè)信息化起步不久，還沒有全面推開。相當多數(shù)企業(yè)尚未熟悉到，電子商務能給他們帶來比大企業(yè)更為有利的機遇，而認為電子商務距離他們比較遙遠。所以，培育和開發(fā)企業(yè)需求，成了在中國發(fā)展電子商務的基本功，而發(fā)展電子商務正是企業(yè)走向成功之路

金融服務質(zhì)量問題。電子商務的進行需要支付與結算，這就應有高質(zhì)、高效的金融服務及其電子化的配合。由于金融服務的水平和電子化程度都還不高，中國的金融業(yè)亟需適應全球一體化進程而加快變革步伐。

信息網(wǎng)絡的環(huán)境、條件和安全問題。作為一個安全的電子商務系統(tǒng)，首先必須具有一個安全、可靠的通信網(wǎng)絡，以保證交易信息安全、迅速地傳遞;其次必須保證數(shù)據(jù)庫服務器絕對安全，防止黑客闖入網(wǎng)絡盜取信息。對于中國來說，網(wǎng)絡產(chǎn)品幾乎都是“舶來品“，本身就隱藏著不安全隱患，加之受技術、人為等因素的影響，不安全因素更顯突出。

跨部門、跨地區(qū)的協(xié)調(diào)問題。參與電子商務的不僅僅是交易雙方，更重要的是，它還涉及工商行政治理、海關、保險、財稅、銀行等眾多部門和不同地區(qū)、不同國家，這就需要有統(tǒng)一的法律、行政框架以及強有力的綜合協(xié)調(diào)組織。

人員素質(zhì)和技能問題。電子商務是新生事物，它的知識亟需普及。全世界因特網(wǎng)網(wǎng)上的商業(yè)用戶和家庭用戶急劇增加，但因特網(wǎng)的使用者仍集中在年齡為15~50歲之間、中上收入水平、受過中等以上教育的中青年，并以男性為主。對中國來說，非凡需要提高商務人員的業(yè)務素質(zhì)和網(wǎng)絡技能。

網(wǎng)絡基礎設施建設問題。要想實現(xiàn)真正實時的網(wǎng)上交易，要求網(wǎng)絡有非常快的響應速度和較高的帶寬，這必須由硬件提供對高速網(wǎng)絡的支持。我國網(wǎng)絡的基礎設施建設還比較緩慢和滯后，已建成的網(wǎng)絡其質(zhì)量離電子商務的要求相距甚遠。另一方面，上網(wǎng)用戶少，網(wǎng)絡利用率低，致使網(wǎng)絡資源大量閑置和浪費，投資效益低，嚴重制約著網(wǎng)絡的進一步發(fā)展。同時，與銀行、稅務等十幾個部門的聯(lián)網(wǎng)尚未實現(xiàn)。因此，如何加大基礎設施建設的力度，提高投資效益，改變網(wǎng)絡通信方面的落后面貌，應是促進電子商務應用普及的首要問題。